Компания Anthropic заявила об обнаружении с помощью языковой модели Claude ферментной системы, свойства которой напоминают инструмент редактирования генов Crispr. Об этом сообщила Wired, сославшись на объявление Anthropic от 23 сентября. Открытие стало первым результатом работы исследовательской группы компании, созданной в начале этого года.
По данным Anthropic, около 950 агентов Claude одновременно анализировали генетические последовательности в течение 21,5 часа. Система искала в крупных геномных базах данных новые примеры обратных транскриптаз — белков, копирующих РНК в ДНК. Такие процессы противоположны обычной передаче информации в клетках, однако используются разными организмами, в том числе для встраивания фрагментов ДНК.
Сначала модель обнаружила более 200 тысяч возможных обратных транскриптаз. Затем она отобрала несколько тысяч предположительно новых вариантов и сузила поиск до необычного семейства с длинным участком повторяющихся последовательностей ДНК, напоминающих Crispr. Anthropic назвала найденную систему ART — сокращение от array-associated reverse transcriptases, то есть обратных транскриптаз, связанных с массивами повторов. Она встречается у крупных фагов — вирусов, поражающих бактерии.
При этом учёные пока не установили, какую именно функцию выполняет ART и можно ли применять её для редактирования генов. Технический отчёт Anthropic, в котором описан один физический эксперимент, ещё не прошёл экспертную оценку. Сама компания признала: «Мы пока не понимаем, что делает эта система», добавив, что лишь несколько известных систем обладают похожими свойствами и все они способны вырезать, копировать и вставлять ДНК.
Исследователь Стэнфордского университета Ле Конг призвал не спешить с выводами: «Эксперименты всё ещё в очереди. А пиар уже запущен». Он сравнил результат с блестящим предметом, найденным среди песка: только лабораторная проверка покажет, оказался ли он стеклом или алмазом. Эксперт по редактированию генов Фёдор Урнов из Калифорнийского университета в Беркли, напротив, похвалил Anthropic за публичное сообщение об открытии, хотя Институт инновационной геномики, где он отвечает за терапевтические исследования, сотрудничает с компанией и не участвовал в этой работе.
Некоторые специалисты считают, что найденная система может быть ретроном, а не новым вариантом Crispr. Оба типа механизмов относятся к бактериальным системам защиты, однако ретроны не обладают такой универсальностью, как Crispr, хотя их уже применяли при создании инструментов редактирования генов. Сет Шипман из институтов Гладстона считает открытие интересным, но подчёркивает: «Новым является то, как они это нашли, а не то, что это такое». Anthropic, создавшая лабораторию для исследований лекарств, намерена продолжить изучение системы.